Подготовка специалистов в области изучения водных объектов формирование их режима, математическое моделирование процессов, в них протекающих, прогноз опасных явлений (половодье, паводки и другие), расчеты гидрологических характеристик при хозяйственном использовании водных объектов, экологическое состояние водоемов. Основными направлениями научной деятельности института являются исследование водного режима рек, озер, водохранилищ и др.